Мегатрон повержен, свергнут и сослан. Десептиконами командует Скорпонок. Автоботы же заняты одним мятежным отрядом. Но сама жизнь на Кибертроне вот-вот окажется под угрозой, когда обнаружится древняя сила, дремавшая под поверхност...

Прошло некоторое время после битвы в Каоне. Десептиконы быстро распространяют своё влияние на другие области Кибертрона, привлекая на свою сторону всех недовольных правящим режимом. Место Сентинела Прайма, павшего от руки Мегатрон...

Оптимус Прайм прибывает на Кибертрон и узнаёт, что кто-то истребляет десептиконов. Вместе со Старскримом, Виндблейд и диноботами он принимается за расследование....

После поражения Триптикона мирное население покидает планету так быстро, что их никто не может даже сосчитать. Оптимус Прайм восстанавливает силы, а Мегатрон пытается собрать своих рассредоточившихся бойцов. Но каждой стороне есть...